La relation de la microflore lactique avec l'homme n'a été que très peu étudiée dans le contexte des aliments amylacés fermentés tropicaux. La plupart des recherches dans ce domaine sont réalisées par des combinaisons de tests phénotypiques. Cependant, la disponibilité des données génomiques permettent d'envisager de nouvelles stratégies. L'objectif de ce travail est de rechercher la présence de gènes impliqués dans des fonctions probiotiques dans une collection de bactéries lactiques isolées d'un aliment fermenté africain, le ben-saalga. Le criblage génétique est efficace pour déterminer le potentiel lié à certaines fonctions «simples», mais des tests in vitro complémentaires montrent les limites de l'approche moléculaire appliquée à la détection de fonctions plus «complexes». Nous avons montré qu'un mélange des trois souches les plus prometteuses modifie le profil de protéines impliquées dans la maturation de l'épithélium intestinal de rats initialement axéniques. Nous pouvons conclure que le criblage génétique permet de mettre en évidence un potentiel probiotique et nutritionnel prometteur.
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