L'objectif de cette étude, est d'analyser la qualité microbiologique et parasitologique des poissons consommés dans la ville de Ouagadougou.Une enquête a d'abord été menée auprès des vendeurs de poissons pour évaluer les conditions d'hygiène de la manutention des poissons. Ensuite des analyses microbiologiques et parasitologiques, visant à dénombrer et à isoler certaines bactéries et des parasites métazoaires. Au total, 40 échantillons de poissons frais, frits, fumés et braisés ont été analysés de Mai à Novembre 2013. Les résultats obtenus ont montré une prédominance de femmes dans la transformation du poisson, des acteurs majoritairement illettrés sans aucune formation en bonnes pratiques d'hygiène et de fabrication. En conséquence, 57,5%, 55%, et 7,5% des échantillons ont été trouvés non satisfaisants respectivement vis-à-vis de Staphylococcus aureus, des coliformes fécaux et des levures et moisissures. En outre, 1%, 15% et 25% des échantillons renfermaient respectivement Shigella sp., E. coli, et Salmonella sp. Une présence massive de larves de Mucidae sur les poissons fumés, des trématodes, des acanthocéphales et quelques nématodes sur le poisson frais a été observée.
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